RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ENC1	O14682	589 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	DKK1	O94907	266 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	C1S	P09871	688 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	SHC2	P98077	582 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PTS	Q03393	145 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	MTM1	Q13496	603 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGEF7	Q14155	803 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	GALNT3	Q14435	633 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	NFATC4	Q14934	902 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PCSK7	Q16549	785 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CDKN3	Q16667	212 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	QPCT	Q16769	361 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ALG11	Q2TAA5	492 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC181	Q5TID7	509 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF567	Q8N184	647 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	DTD2	Q96FN9	168 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	HES6	Q96HZ4	224 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIB3	Q96RU7	358 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	LGR4	Q9BXB1	951 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	AKAP13	Q12802	2813 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM202	A6NGA9	273 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985		H7C0C1	242 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PSMD11	O00231	422 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TOR1B	O14657	336 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	SCAMP1	O15126	338 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PMPCB	O75439	489 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	GCAT	O75600	419 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CLDN7	O95471	211 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PIRT	P0C851	137 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	MYF5	P13349	255 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	NFKB1	P19838	968 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CA4	P22748	312 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	NFKBIA	P25963	317 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	RBL1	P28749	1068 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM23	P36406	574 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP5O	P48047	213 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	STC1	P52823	247 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	XRCC4	Q13426	336 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	C1orf61	Q13536	156 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TCEA2	Q15560	299 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PROX2	Q3B8N5	592 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	FAXC	Q5TGI0	409 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	PNCK	Q6P2M8	343 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	HID1	Q8IV36	788 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	OR4C6	Q8NH72	309 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC61	Q9BV99	259 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	CLPB	Q9H078	707 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	MYLK	Q15746	1914 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.23	□□□□□ -0.61

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