RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF883	P0CG24	379 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PSMD7	P51665	324 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MTTP	P55157	894 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BNC1	Q01954	994 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PTK2	Q05397	1052 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GRIK2	Q13002	908 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DNAJC3	Q13217	504 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ITGA9	Q13797	1035 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ST3GAL2	Q16842	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FSCB	Q5H9T9	825 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ACAD11	Q709F0	780 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF366	Q8N895	744 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	STMN2	Q93045	179 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SAR1A	Q9NR31	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FRY	Q5TBA9	3013 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CACNA1B	Q00975	2339 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	VILL	O15195	856 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BIRC5	O15392	142 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CRABP2	P29373	138 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ATP5D	P30049	168 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ACSL1	P33121	698 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PTGIR	P43119	386 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	VPS41	P49754	854 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PLK1	P53350	603 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CDC16	Q13042	620 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SLC12A1	Q13621	1099 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TAF5	Q15542	800 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PPP2R5E	Q16537	467 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	KLHL35	Q6PF15	583 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	LYPD8	Q6UX82	237 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	USP30	Q70CQ3	517 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	LGI2	Q8N0V4	545 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB106A	Q8N104	65 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	C18orf8	Q96DM3	657 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	USP29	Q9HBJ7	922 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SGK2	Q9HBY8	427 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SCML1	Q9UN30	329 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PTPRB	P23467	1997 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC22	O60826	627 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SIN3B	O75182	1162 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	DAB1	O75553	588 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ACSL3	O95573	720 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	SEMA4F	O95754	770 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	ERBB2	P04626	1255 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	PROS1	P07225	676 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FGD4-215	ENST00000551984	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36

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