RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PQH9 124 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 IL17AQ16552 155 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 TRIM63Q969Q1 353 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 MACC1Q6ZN28 852 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CEP68Q76N32 757 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC103Q8IW40 242 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 LINGO1Q96FE5 620 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CAPN10Q9HC96 672 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.5□□□□□ -1.05
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