RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549340.5

LETMD1-218, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LETMD1, Length 818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-218ENST00000549340 ITM2AO43736 263 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 ARHGEF15O94989 841 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 UNC5CO95185 931 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 SBK3P0C264 359 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 CD9P21926 228 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 PMLP29590 882 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 SERPINB5P36952 375 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 EPHB1P54762 984 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 BCL2L1Q07817 233 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 DLG1Q12959 904 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 ACAP2Q15057 778 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 PLPP6Q8IY26 295 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 TTC16Q8NEE8 873 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 BHMTQ93088 406 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 SORT1Q99523 831 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 NDNQ99608 321 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 DRC3Q9H069 523 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 GPAMQ9HCL2 828 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 PLK2Q9NYY3 685 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 XPR1Q9UBH6 696 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 HAO1Q9UJM8 370 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.65□□□□□ -0.06
LETMD1-218ENST00000549340 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 A0A1W2PQ67 120 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CCDC189A1A4V9 331 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 H0YHG0 523 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 K7ERQ8 282 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TK2O00142 265 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NPHS1O60500 1241 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SRCP12931 536 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SERPINA4P29622 427 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HLA-FP30511 346 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HMGCLP35914 325 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TTPAP49638 278 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RASSF2P50749 326 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PFKPQ01813 784 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZBTB16Q05516 673 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SEMA3AQ14563 771 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF460Q14592 562 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PTPRCAPQ14761 206 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 KRT72Q14CN4 511 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TMEM25Q86YD3 366 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RIN3Q8TB24 985 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LPGAT1Q92604 370 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 BBS2Q9BXC9 721 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 IL17CQ9P0M4 197 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PKP3Q9Y446 797 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.64□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 A0A0J9YYE9 177 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 F8W8V4 182 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CCDC22O60826 627 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NDUFS3O75489 264 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PRAMEF12O95522 483 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HSPA4LO95757 839 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TRBC1P01850 177 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CA3P07451 260 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 MYOGP15173 224 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SLC8A1P32418 973 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ABL2P42684 1182 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PTPN5P54829 565 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 AQP5P55064 265 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms