RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 TAS2R13Q9NYV9 303 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF609O15014 1411 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 GRK1Q15835 563 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 OR4C6Q8NH72 309 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 ITCHQ96J02 903 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 HMGCRP04035 888 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 IDO1P14902 403 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 PAQR7Q86WK9 346 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 HPDLQ96IR7 371 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 PHOX2BQ99453 314 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 UFD1Q92890 307 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 PHB2Q99623 299 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 SYT15Q9BQS2 421 aa8.63□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 GGA3Q9NZ52 723 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.62□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 BEX2Q9BXY8 128 aa8.62□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 SNAP29O95721 258 aa8.62□□□□□ -1.03
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ATXN3-216ENST00000545170 CDKN2CP42773 168 aa8.62□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TAS2R41P59536 307 aa8.62□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ATXN3-216ENST00000545170 CBLBQ13191 982 aa8.62□□□□□ -1.03
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