RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF711Q9Y462 761 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 HPDP32754 393 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 WASP42768 502 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 TNFRSF4P43489 277 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 ABCG1P45844 678 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 GRM3Q14832 879 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO43Q4G163 708 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 NEPROQ6NW34 567 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 TSPAN33Q86UF1 283 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 UCMAQ8WVF2 138 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 SPOCK2Q92563 424 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 SCRN2Q96FV2 425 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 SERAC1Q96JX3 654 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 CLDN7O95471 211 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 TIMP2P16035 220 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 SEC13P55735 322 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 CNTN4Q8IWV2 1026 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 OR6P1Q8NGX9 317 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 IL17CQ9P0M4 197 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf81A6NN90 581 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC7A4O43246 635 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 GOT2P00505 430 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 AHSGP02765 367 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 PRSS56P0CW18 603 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT15P19012 456 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 PAMP19021 973 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 NAB1Q13506 487 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 LAMB3Q13751 1172 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 ENPP2Q13822 863 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC32Q14392 662 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 MROH9Q5TGP6 573 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 PAF1Q8N7H5 531 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 PEX13Q92968 403 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 HACD3Q9P035 362 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 CAPN8A6NHC0 703 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 EGFP01133 1207 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 CBX1P83916 185 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 MPP1Q00013 466 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 MPP2Q14168 576 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 LYSMD1Q96S90 227 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 CPNE1Q99829 537 aa21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-209ENST00000532457 TSPAN11A1L157 253 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 NR1D1P20393 614 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 TIE1P35590 1138 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 GP5P40197 560 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC1A2P43004 574 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 SEMA3AQ14563 771 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 UGP2Q16851 508 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 TRABDQ9H4I3 376 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 FKBPLQ9UIM3 349 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM221A6NGB7 291 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM170BA6NMN3 283 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 M0R296 226 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 EPHX1P07099 455 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 LHCGRP22888 699 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 HMGCLP35914 325 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP1A2P50993 1020 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 PRAMEP78395 509 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms