RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526105.5

SLC38A6-208, Transcript of solute carrier family 38 member 6, human

TSL 3

Gene SLC38A6, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A6-208	ENST00000526105	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105		A6NCN8	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZIC3	O60481	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	DOK2	O60496	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CH25H	O95992	272 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	HOXC6	P09630	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	RARG	P13631	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMEM11	P17152	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ALOX12	P18054	663 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	MAPK4	P31152	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	MXI1	P50539	228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZBED6	P86452	979 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TFAP4	Q01664	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TRAF2	Q12933	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	SCAMP1	O15126	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	HCRTR2	O43614	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	TSPAN9	O75954	239 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	GFPT2	O94808	682 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	PRSS2	P07478	247 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	CYC1	P08574	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	MCM3	P25205	808 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	ARRB2	P32121	409 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	STX2	P32856	288 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	PCYT1A	P49585	367 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	ABAT	P80404	500 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105		Q0VFX4	171 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	LRMP	Q12912	555 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	NAB2	Q15742	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	HLF	Q16534	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	MEA1	Q16626	185 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105		J3KR12	359 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	VCY	O14598	125 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	VILL	O15195	856 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	HSPA12A	O43301	675 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	KCNJ13	O60928	360 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	CLTB	P09497	229 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	G6PD	P11413	515 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	MAOA	P21397	527 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	TM4SF1	P30408	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	PSMB10	P40306	273 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	CDH8	P55286	799 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLC38A6-208	ENST00000526105	MC1R	Q01726	317 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms