RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525778.5

SOGA3-203, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 4,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-203ENST00000525778 FAM50BQ9Y247 325 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 GMPPBQ9Y5P6 360 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 SLC2A4P14672 509 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TAF6P49848 677 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 RAD51Q06609 339 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 APOFQ13790 326 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 METTL6Q8TCB7 284 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 POLG2Q9UHN1 485 aa18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 NOTOA8MTQ0 251 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 EVPLLA8MZ36 301 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 AURKAO14965 403 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 CAPN1P07384 714 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 CES1P23141 567 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 PIGFQ07326 219 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 DDR2Q16832 855 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 ASB2Q96Q27 587 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 ERAP1Q9NZ08 941 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF221Q9UK13 617 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 VWA7Q9Y334 891 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 PLCH1Q4KWH8 1693 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 GLP2RO95838 553 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 CD4P01730 458 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 FUCA1P04066 466 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 PTPN3P26045 913 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TMBIM6P55061 237 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 GRM1Q13255 1194 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 ZFP69Q49AA0 526 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 DEPDC1Q5TB30 811 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 STYK1Q6J9G0 422 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 METTL7BQ6UX53 244 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 HOMEZQ8IX15 550 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 STX19Q8N4C7 294 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 MAF1Q9H063 256 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 GIMAP2Q9UG22 337 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 F9P00740 461 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 IGFN1Q86VF2 1251 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TMEM192Q8IY95 271 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 MCOLN3Q8TDD5 553 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 CARD8Q9Y2G2 431 aa18.09■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 SLC22A3O75751 556 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 MSH3P20585 1137 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 BACE1P56817 501 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 GPR158Q5T848 1215 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 FAR1Q8WVX9 515 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TFAP2CQ92754 450 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 HGH1Q9BTY7 390 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TKTL2Q9H0I9 626 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 RASSF1Q9NS23 344 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 EXD2Q9NVH0 621 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 INVSQ9Y283 1065 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 C9IYK1 514 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 PLA2G6O60733 806 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 NIPAL4Q0D2K0 466 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 RABL3Q5HYI8 236 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 RNF38Q9H0F5 515 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.08■□□□□ 0.49
SOGA3-203ENST00000525778 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 G3V2L1 256 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 AHSGP02765 367 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 UMPSP11172 480 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 IL12RB1P42701 662 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 CLCN5P51795 746 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 ARPP19P56211 112 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 TUBB3Q13509 450 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 STRADAQ7RTN6 431 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 PIP5K1BO14986 540 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 GRID2O43424 1007 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 SERPINB7O75635 380 aa18.08■□□□□ 0.48
SOGA3-203ENST00000525778 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms