RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 HAUS5O94927 633 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ALPIP09923 528 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 BMP1P13497 986 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TAC1P20366 129 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TYK2P29597 1187 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ABL2P42684 1182 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CCT5P48643 541 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 STC1P52823 247 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SEC24CP53992 1094 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 POU4F1Q01851 419 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 PPARDQ03181 441 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 HTR4Q13639 388 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SEMA3AQ14563 771 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TCF12Q99081 682 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CIPCQ9C0C6 399 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 DCDC2Q9UHG0 476 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.05■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 LAMA3Q16787 3333 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 A0A096LPK6 155 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 PLIN3O60664 434 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 C2P06681 752 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 COL6A2P12110 1019 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CRABP2P29373 138 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 HNF1BP35680 557 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ABCG1P45844 678 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SERPINB4P48594 390 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SUOXP51687 545 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 PTPN5P54829 565 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 PEX6Q13608 980 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 GRM2Q14416 872 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 PTPRRQ15256 657 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ACCSLQ4AC99 568 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 HHATQ5VTY9 493 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CNSTQ6PJW8 725 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 YAF2Q8IY57 180 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 MYLIPQ8WY64 445 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 KXD1Q9BQD3 176 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM245Q9H330 911 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 MYO9BQ13459 2157 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 KLF11O14901 512 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 BIRC5O15392 142 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 IL1BP01584 269 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 PROCP04070 461 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 UGT2B4P06133 528 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CTPS1P17812 591 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TAS2R39P59534 338 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 RAB10P61026 200 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TMPRSS15P98073 1019 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 PPM1JQ5JR12 505 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 USP45Q70EL2 814 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 GDAP1Q8TB36 358 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 LPGAT1Q92604 370 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 OMDQ99983 421 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 CD207Q9UJ71 328 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.02■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SNHG6-201ENST00000520348 AGAP14A8MT82 685 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms