RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519894.1

FBXO28-204, Transcript of F-box protein 28, humanhuman

TSL 2

Gene FBXO28, Length 729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28-204ENST00000519894 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CDKN3Q16667 212 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 GUSBP11Q6P575 273 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 NPNTQ6UXI9 565 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 ATL2Q8NHH9 583 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 IFI44Q8TCB0 444 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 NUS1Q96E22 293 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 DTD2Q96FN9 168 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 PDXPQ96GD0 296 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CHKBQ9Y259 395 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 ALG6Q9Y672 507 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.95□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 KNTC1P50748 2209 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 A0A0J9YYE9 177 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CPED1A4D0V7 1026 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 KCNK1O00180 336 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TRBC1P01850 177 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 ZBTB17Q13105 803 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 ARHGEF7Q14155 803 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 ELOCQ15369 112 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 NR0B2Q15466 257 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TCEA2Q15560 299 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 Q6ZVL8 140 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 USP45Q70EL2 814 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 RFX6Q8HWS3 928 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CNTD1Q8N815 330 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 FGF22Q9HCT0 170 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 AKAP13Q12802 2813 aa14.94□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TNFRSF10CO14798 259 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 SPOPO43791 374 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 MMP2P08253 660 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 PTSQ03393 145 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TAZQ16635 292 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 PERM1Q5SV97 790 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 LRRC66Q68CR7 880 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 GLMNQ92990 594 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 OLFM3Q96PB7 478 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TEX101Q9BY14 249 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 WDR26Q9H7D7 661 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 USP24Q9UPU5 2620 aa14.93□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 FRYQ5TBA9 3013 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 PSTPIP1O43586 416 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 TGM2P21980 687 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 FECHP22830 423 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 KELP23276 732 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 CDKN2BP42772 138 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 EPHB1P54762 984 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 DYNLT1P63172 113 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 SKOR1P84550 965 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 AP1B1Q10567 949 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 RTP5Q14D33 572 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 PDK1Q15118 436 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 SPA17Q15506 151 aa14.92□□□□□ -0.02
FBXO28-204ENST00000519894 ODF2Q5BJF6 829 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms