RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517275.3

RNU6-840P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 840, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-840P, Length 65 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-840P-201ENST00000517275 HSPB6O14558 160 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MDM4O15151 490 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 KLKB1P03952 638 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TSPY3P0CV98 308 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TSPY8P0CW00 308 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CTSAP10619 480 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PRLRP16471 622 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MAOAP21397 527 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MUTP22033 750 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 HOXC8P31273 242 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TNFSF8P32971 234 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 RASSF2P50749 326 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ARSEP51690 589 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CLCN3P51790 818 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PROK1P58294 105 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ADORA2A-AS1P86434 159 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TSPY1Q01534 308 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SPOCK1Q08629 439 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 FOXF2Q12947 444 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 IL11RAQ14626 422 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 LPIN1Q14693 890 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CLEC17AQ6ZS10 378 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MTSS1LQ765P7 747 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 RASSF8Q8NHQ8 419 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 NSMCE1Q8WV22 266 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 IGSF8Q969P0 613 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TMEM18Q96B42 140 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 HARBI1Q96MB7 349 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ACOX2Q99424 681 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PAFAH2Q99487 392 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 AGAP2Q99490 1192 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SLC25A23Q9BV35 468 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 B3GNT4Q9C0J1 378 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TASP1Q9H6P5 420 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 THSD1Q9NS62 852 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ABCF3Q9NUQ8 709 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 AMACRQ9UHK6 382 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TUBE1Q9UJT0 475 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ZNF148Q9UQR1 794 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 INSL6Q9Y581 213 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 WIPF3A6NGB9 483 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MATN3O15232 486 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SLC25A17O43808 307 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 BCAR3O75815 825 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 GGPS1O95749 300 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MMP9P14780 707 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 IL7RP16871 459 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 GNLYP22749 145 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CPT2P23786 658 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PTAFRP25105 342 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CERS1P27544 350 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PLA2G5P39877 138 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 FASLGP48023 281 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 MMP14P50281 582 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 CCR3P51677 355 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ECT2LQ008S8 904 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 COL10A1Q03692 680 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 DDR1Q08345 913 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SREBF2Q12772 1141 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 NAE1Q13564 534 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 KCNC3Q14003 757 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 COG2Q14746 738 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 DUSP6Q16828 381 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 TMEM71Q6P5X7 295 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-840P-201ENST00000517275 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms