RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, human

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF4-218	ENST00000513284	PRSS38	A1L453	326 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	DNAJB5	O75953	348 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ZNF28	P17035	718 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	FLT3	P36888	993 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	MMP12	P39900	470 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	APBA1	Q02410	837 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ELP6	Q0PNE2	266 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	PAK1	Q13153	545 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	PNCK	Q6P2M8	343 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	LIPI	Q6XZB0	460 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	FAM131B	Q86XD5	332 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	NELFB	Q8WX92	580 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	MAGEH1	Q9H213	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	BUB1	O43683	1085 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	RHOQ	P17081	205 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	POLD2	P49005	469 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	PMS2	P54278	862 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CTBS	Q01459	385 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	RAD51	Q06609	339 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TTI2	Q6NXR4	508 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	HIVEP1	P15822	2718 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	FAM170A	A1A519	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TEX33	O43247	280 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	RFPL1	O75677	317 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	EML2	O95834	649 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	IGSF6	O95976	241 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	KEL	P23276	732 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	DLST	P36957	453 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ETFB	P38117	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	GABRB2	P47870	512 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	MAPKAPK2	P49137	400 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	MAP7	Q14244	749 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	AFMID	Q63HM1	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284		Q8NA96	180 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ZPBP	Q9BS86	351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	POLH	Q9Y253	713 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	F8	P00451	2351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284		A8MX80	341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ZW10	O43264	779 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	RAMP2	O60895	175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	LRIG2	O94898	1065 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	SLC9A1	P19634	815 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ADRA1B	P35368	520 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	CLCN1	P35523	988 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	ADCY8	P40145	1251 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	USP8	P40818	1118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	GNPDA1	P46926	289 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RNF4-218	ENST00000513284	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62

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