RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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SH3BP2-208ENST00000504294 DCDC1P59894 354 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 INPP5AQ14642 412 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
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SH3BP2-208ENST00000504294 ARMC3Q5W041 872 aa14.53□□□□□ -0.08
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