RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 OR6B2Q6IFH4 312 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 SYT13Q7L8C5 426 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 MAP4K3Q8IVH8 894 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 PLPP7Q8NBV4 271 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 COL26A1Q96A83 441 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM159Q96B96 161 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 HDAC11Q96DB2 347 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 KCNN4O15554 427 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 TM7SF2O76062 418 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 TNFAIP8O95379 198 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 S100A6P06703 90 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 ARL4AP40617 200 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 HNF4AP41235 474 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 ELK3P41970 407 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 ACOT2P49753 483 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 GRM3Q14832 879 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 SMTNL2Q2TAL5 461 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 ACSBG2Q5FVE4 666 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 PLA2G4FQ68DD2 849 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 CHSY1Q86X52 802 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 PHOX2BQ99453 314 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 CDHR5Q9HBB8 845 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 EMC3Q9P0I2 261 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 TAF1P21675 1872 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 TISP43B9A030 160 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 APOL1O14791 398 aa3.95□□□□□ -1.78
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ANKRD28-213ENST00000498524 ADRB2P07550 413 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 SERPINF2P08697 491 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 IRF1P10914 325 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 S100A5P33763 92 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 HOXD13P35453 343 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 IL12RB1P42701 662 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 SEPHS1P49903 392 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 MGAT3Q09327 533 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 MAMLD1Q13495 774 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 ITGA9Q13797 1035 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 FLOT2Q14254 428 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 DSC3Q14574 896 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 CDO1Q16878 200 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 MTFR2Q6P444 385 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-213ENST00000498524 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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