RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ZNF567Q8N184 647 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TTC13Q8NBP0 860 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 COG1Q8WTW3 980 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TEKT5Q96M29 485 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 USP29Q9HBJ7 922 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GLOD4Q9HC38 313 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 AMACRQ9UHK6 382 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 OR1A2Q9Y585 309 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 A0A1W2PQ67 120 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SCAMP1O15126 338 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ZNF185O15231 689 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 FFAR2O15552 330 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PIAS2O75928 621 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 NFKB1P19838 968 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CES1P23141 567 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ETV3P41162 512 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 THOP1P52888 689 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 EPHB1P54762 984 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 FOXK2Q01167 660 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TCEA2Q15560 299 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PID1Q7Z2X4 250 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 RBFAQ8N0V3 343 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SLC25A45Q8N413 288 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SPOCK2Q92563 424 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SCRN2Q96FV2 425 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 COQ10AQ96MF6 247 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 APOOQ9BUR5 198 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 KCND1Q9NSA2 647 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 UBP1Q9NZI7 540 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SNX12Q9UMY4 172 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PTPRBP23467 1997 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 A0A0J9YYE9 177 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 K7ESM1 405 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 YKT6O15498 198 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 LIASO43766 372 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TRBC1P01850 177 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 DGKAP23743 735 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PMLP29590 882 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GDF10P55107 478 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 DNAJC3Q13217 504 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GALNT3Q14435 633 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PCSK7Q16549 785 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 LRRC66Q68CR7 880 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 KCTD16Q68DU8 428 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 USP45Q70EL2 814 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PARGQ86W56 976 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 NUS1Q96E22 293 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PBKQ96KB5 322 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CD84Q9UIB8 345 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CFAP69A5D8W1 941 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TRIM38O00635 465 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 MTSS1O43312 755 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CSF2P04141 144 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 C1SP09871 688 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 MYF5P13349 255 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 JUNDP17535 347 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 YPEL5P62699 121 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 C1orf61Q13536 156 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ARHGEF7Q14155 803 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 AGERQ15109 404 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 QPCTQ16769 361 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 INAVAQ3KP66 663 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms