RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492766.5

RERE-215, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, human

TSL 3

Gene RERE, Length 367 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RERE-215	ENST00000492766	P3H1	Q32P28	736 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	DENND2C	Q68D51	928 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	NUS1	Q96E22	293 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FICD	Q9BVA6	458 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CES2	O00748	559 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ZNF185	O15231	689 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ANXA9	O76027	345 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	METTL18	O95568	372 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ITGAV	P06756	1048 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ADRA1A	P35348	466 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	RABIF	P47224	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ID4	P47928	161 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PFN3	P60673	137 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	OLIG2	Q13516	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766		Q6ZSR6	202 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	GAREM1	Q9H706	876 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ZNF711	Q9Y462	761 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	LAMA1	P25391	3075 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766		K7ESM1	405 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SLC30A4	O14863	429 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CLDN7	O95471	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	IFNB1	P01574	187 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	EPO	P01588	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SLC4A1	P02730	911 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FGF1	P05230	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ETS1	P14921	441 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	HLA-DPA1	P20036	260 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PTS	Q03393	145 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	MTM1	Q13496	603 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PRPSAP1	Q14558	356 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SHB	Q15464	509 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SLC1A5	Q15758	541 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766		Q6ZVL8	140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766		A0A1B0GTQ1	180 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	AGT	P01019	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	KCNJ1	P48048	391 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CCT8	P50990	548 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	IL9R	Q01113	521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	FZD2	Q14332	565 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	EID2B	Q96D98	161 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RERE-215	ENST00000492766	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms