RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 NT5MQ9NPB1 228 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPN4-211ENST00000488279 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPN4-211ENST00000488279 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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PTPN4-211ENST00000488279 ARHGEF7Q14155 803 aa22.61■■□□□ 1.21
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PTPN4-211ENST00000488279 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPN4-211ENST00000488279 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPN4-211ENST00000488279 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-211ENST00000488279 TMEM74Q96NL1 305 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF670Q9BS34 389 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-211ENST00000488279 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-211ENST00000488279 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-211ENST00000488279 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-211ENST00000488279 CDRT15L2A8MXV6 281 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-211ENST00000488279 B4DGG1 531 aa22.57■■□□□ 1.2
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