RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 ECHS1P30084 290 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 OXTRP30559 389 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 VIPR1P32241 457 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HADHAP40939 763 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PSMD8P48556 350 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SHC2P98077 582 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SPARCL1Q14515 664 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CCDC38Q502W7 563 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 KIAA1211LQ6NV74 962 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZS52 159 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CYS1Q717R9 158 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 DPPA4Q7L190 304 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RASSF3Q86WH2 238 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SIGLEC10Q96LC7 697 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 KIFC1Q9BW19 673 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ITM2CQ9NQX7 267 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.73□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FRYQ5TBA9 3013 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 AREL1O15033 823 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 AXIN1O15169 862 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MID1O15344 667 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 POLBP06746 335 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GABRG2P18507 467 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PAMP19021 973 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 LPOP22079 712 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 DRD3P35462 400 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HNF1BP35680 557 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HMGCLP35914 325 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 P2RY2P41231 377 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GRIA1P42261 906 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 VSNL1P62760 191 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF7Q14155 803 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GALNT3Q14435 633 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TRADDQ15628 312 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ELF2Q15723 593 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 BBS9Q3SYG4 887 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TMEM52BQ4KMG9 183 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FNBP1LQ5T0N5 605 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 LONP2Q86WA8 852 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 STYXQ8WUJ0 223 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CAVIN3Q969G5 261 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ARRDC3Q96B67 414 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 APOL2Q9BQE5 337 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SGK2Q9HBY8 427 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PREBQ9HCU5 417 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FBXL12Q9NXK8 326 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SOX13Q9UN79 622 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CKAP5Q14008 2032 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ANTXRLA6NF34 631 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MROH6A6NGR9 719 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 K7ESF4 209 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 USP1O94782 785 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PGAM1P18669 254 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NDUFV2P19404 249 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MGAT1P26572 445 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CNR2P34972 360 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PHBP35232 272 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NUDT1P36639 197 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MMP12P39900 470 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MAGEA4P43358 317 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CHRNA4P43681 627 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms