RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473380.1

MSL3-211, Transcript of MSL complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene MSL3, Length 433 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3-211ENST00000473380 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 BTN3A1O00481 513 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SCDO00767 359 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 TGFB1I1O43294 461 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 NOBOXO60393 691 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 CIB2O75838 187 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 DDAH2O95865 285 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 AK1P00568 194 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 KRT6BP04259 564 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 NTRK1P04629 796 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 STAG3L3P0CL85 134 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 PRKAR1AP10644 381 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 UROSP10746 265 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ALADP13716 330 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 IFNGR1P15260 489 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 AHCYP23526 432 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 NR2F2P24468 414 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 KLRC1P26715 233 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 IL1R2P27930 398 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SREBF1P36956 1147 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 PTGER3P43115 390 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 GPD2P43304 727 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SLC15A1P46059 708 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 KRT6CP48668 564 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 CLCN4P51793 760 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 STAT2P52630 851 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 METAP1P53582 386 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 HUNKP57058 714 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 FAM189BP81408 668 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 DR1Q01658 176 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SPIBQ01892 262 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 MGAT2Q10469 447 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ABRQ12979 859 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 RAB32Q13637 225 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 RAPSNQ13702 412 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 TRIM60Q495X7 471 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 CFAP157Q5JU67 520 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ZNF600Q6ZNG1 722 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SLC15A4Q8N697 577 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 LPCAT1Q8NF37 534 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ST7LQ8TDW4 575 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SLAMF9Q96A28 289 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 PERPQ96FX8 193 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 LMF1Q96S06 567 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 COQ7Q99807 217 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 PKP2Q99959 881 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 TPPP3Q9BW30 176 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 CDK19Q9BWU1 502 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 CACNG6Q9BXT2 260 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 GREM2Q9H772 168 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 IL21RQ9HBE5 538 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 NGBQ9NPG2 151 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 EHD3Q9NZN3 535 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 KCND2Q9NZV8 630 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 TRPC4Q9UBN4 977 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 CD300AQ9UGN4 299 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 U3KQV3 271 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ABCC6O95255 1503 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 VCANP13611 3396 aa4.75□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.74□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSL3-211ENST00000473380 A0A0G2JLW4 131 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms