RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	LHCGR	P22888	699 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGAP25	P42331	645 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ABCG1	P45844	678 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TAS2R40	P59535	323 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	IHH	Q14623	411 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	NR1D2	Q14995	579 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC38	Q5VT99	294 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	HID1	Q8IV36	788 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PELI3	Q8N2H9	469 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PQLC3	Q8N755	202 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	HDAC11	Q96DB2	347 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PDXP	Q96GD0	296 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	WDR26	Q9H7D7	661 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	AK5	Q9Y6K8	562 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A0J9YYE9	177 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	NOBOX	O60393	691 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	USP12	O75317	370 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	SOD1	P00441	154 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PRL	P01236	227 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TRBC1	P01850	177 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PCCB	P05166	539 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	SEMG2	Q02383	582 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TLE3	Q04726	772 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT81	Q14533	505 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	NFKBIB	Q15653	356 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC14A2	Q15849	920 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	USP45	Q70EL2	814 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CLEC14A	Q86T13	490 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	KY	Q8NBH2	561 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	NUS1	Q96E22	293 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	LGR4	Q9BXB1	951 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ABCG4	Q9H172	646 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	DTL	Q9NZJ0	730 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	INTU	Q9ULD6	942 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PRSS38	A1L453	326 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CPED1	A4D0V7	1026 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	MFAP3L	O75121	409 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CEACAM5	P06731	702 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PYGL	P06737	847 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	IVL	P07476	585 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT10	P13645	584 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CTSE	P14091	401 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	GLB1	P16278	677 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	KDELR1	P24390	212 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	CCKBR	P32239	447 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	GABRE	P78334	506 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ACOX1	Q15067	660 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	TAZ	Q16635	292 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PGAP2-215	ENST00000469307	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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