RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	IFI44	Q8TCB0	444 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GLMN	Q92990	594 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	IL12RB2	Q99665	862 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	APOL1	O14791	398 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MUSK	O15146	869 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TCEA3	O75764	348 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PIAS2	O75928	621 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT1	P04264	644 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ITGB2	P05107	769 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TIMP2	P16035	220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TGM2	P21980	687 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CTNNA2	P26232	953 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GK	P32189	559 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP12	P39900	470 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RPIA	P49247	311 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GBE1	Q04446	702 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	BCL2L1	Q07817	233 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GSE1	Q14687	1217 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PDK1	Q15118	436 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ODF2	Q5BJF6	829 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	DAAM2	Q86T65	1068 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TTC7B	Q86TV6	843 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC25A45	Q8N413	288 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	LRP4	O75096	1905 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CPED1	A4D0V7	1026 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245		A6NNZ2	444 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SCAMP1	O15126	338 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC31A1	O15431	190 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	INSIG1	O15503	277 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MTSS1	O43312	755 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDH8	O95206	1070 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ITGA2B	P08514	1039 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CCNB1	P14635	433 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	GJC1	P36383	396 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PEX5	P50542	639 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	YPEL5	P62699	121 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79	6e-7	■■□□□ 13.9
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NR0B2	Q15466	257 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ERAP2	Q6P179	960 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	BBS12	Q6ZW61	710 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA1328	Q86T90	577 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	PGBD5	Q8N414	524 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SPC24	Q8NBT2	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	NAT6	Q93015	286 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	SGF29	Q96ES7	293 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	EXOC2	Q96KP1	924 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TTLL3-223	ENST00000466245	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79

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