RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 XPR1Q9UBH6 696 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 VPS51Q9UID3 782 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MID2Q9UJV3 735 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CPQQ9Y646 472 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ARL5AQ9Y689 179 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 DENND4AQ7Z401 1863 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 A8MT66 165 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 AGAP14A8MT82 685 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 A8MUI8 341 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 H3BMM5 538 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRRG1O14668 218 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GSC2O15499 205 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB14O43829 449 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KLK8O60259 260 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN3O60637 253 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TBL1XO60907 577 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PEX11AO75192 247 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF15O94989 841 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF12O95522 483 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MT-CO1P00395 513 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GOT2P00505 430 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CHRNGP07510 517 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PIRTP0C851 137 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 IRF1P10914 325 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MTHFD2P13995 350 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 HDCP19113 662 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CALB2P22676 271 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MPSTP25325 297 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GABRR2P28476 465 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRDX6P30041 224 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CDC25CP30307 473 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 HOXA9P31269 272 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 AVPR1AP37288 418 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CSKP41240 450 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CCR10P46092 362 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GRIA4P48058 902 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CLCN4P51793 760 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RAP1GDS1P52306 607 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 INHBCP55103 352 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ADARP55265 1226 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 AP1S1P61966 158 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRR20EP86478 221 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRR20CP86479 221 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRR20DP86480 221 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRR20BP86481 221 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRR20AP86496 221 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CYP4F8P98187 520 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SULT2A1Q06520 285 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PEX6Q13608 980 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ACAP2Q15057 778 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TBCCQ15814 346 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 METTL21CQ5VZV1 264 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RINLQ6ZS11 566 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ISCA2Q86U28 154 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 APCDD1Q8J025 514 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 OR4L1Q8NH43 312 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP61Q8NHU2 1237 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FIBINQ8TAL6 211 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.65□□□□□ -1.5
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