RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 GLMNQ92990 594 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 DTD2Q96FN9 168 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 CST8O60676 142 aa23■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.99■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.99■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 EXD1Q8NHP7 514 aa22.99■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 CLPBQ9H078 707 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.99■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 TEX101Q9BY14 249 aa22.97■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.97■■□□□ 1.27
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PTPN4-208ENST00000460289 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 U3KQA8 63 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 KNTC1P50748 2209 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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