RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445667.6

USE1-202, Transcript of unconventional SNARE in the ER 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene USE1, Length 795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1-202ENST00000445667 U3KQA8 63 aa14.77□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ACACBO00763 2458 aa14.77□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 A0A0J9YYE9 177 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 YY2O15391 372 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TRBC1P01850 177 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ANXA6P08133 673 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CDK4P11802 303 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CTSEP14091 401 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 BLKP51451 505 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 SKOR1P84550 965 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 PTSQ03393 145 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ILKQ13418 452 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 HES3Q5TGS1 186 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 LRRC66Q68CR7 880 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TMEM139Q8IV31 216 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 DTD2Q96FN9 168 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 AGAP3Q96P47 875 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CD84Q9UIB8 345 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.76□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CPED1A4D0V7 1026 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 LMO7DNF2Z398 122 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TPP1O14773 563 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 RASGRP1O95267 797 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TNFP01375 233 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 KIAA1024LP59773 190 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CAMK2BQ13554 666 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CDKN3Q16667 212 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ATL2Q8NHH9 583 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 MDM1Q8TC05 714 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 HAUS1Q96CS2 278 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 PDXPQ96GD0 296 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TBATAQ96M53 351 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 WDR26Q9H7D7 661 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 FGF22Q9HCT0 170 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.75□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 A0A0U1RQJ8 604 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 PSMD11O00231 422 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CLDN7O95471 211 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CAPNS1P04632 268 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CA4P22748 312 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 CDC25BP30305 580 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 NR2C2P49116 596 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 VAV2P52735 878 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 E2F1Q01094 437 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ELOCQ15369 112 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 QPCTQ16769 361 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TEX44Q53QW1 395 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 GUSBP11Q6P575 273 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 KIAA1328Q86T90 577 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 EXD1Q8NHP7 514 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 IFI44Q8TCB0 444 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 SCAMP4Q969E2 229 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 BOCQ9BWV1 1114 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 ABCG8Q9H221 673 aa14.74□□□□□ -0.05
USE1-202ENST00000445667 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms