RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 SUSD3Q96L08 255 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CWH43Q9H720 699 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SPO11Q9Y5K1 396 aa16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 EFCAB14O75071 495 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MYO1DO94832 1006 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CPNE6O95741 557 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CHRNGP07510 517 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CD19P15391 556 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TFEBP19484 476 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PBX3P40426 434 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 GRIA1P42261 906 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CYP2R1Q6VVX0 501 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SNX15Q9NRS6 342 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 HACD3Q9P035 362 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TJP2Q9UDY2 1190 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 E2F8A0AVK6 867 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 JRKO75564 520 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CYP11A1P05108 521 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 VDRP11473 427 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 HPCAL1P37235 193 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 DMPKQ09013 629 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SELENBP1Q13228 472 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM240Q5SV17 173 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CASC4Q6P4E1 433 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM86AQ8N2M4 240 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 RAB2BQ8WUD1 216 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PEBP4Q96S96 227 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TXNDC16Q9P2K2 825 aa16.87■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 GALTP07902 379 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TGM2P21980 687 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ETFBP38117 255 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 OPRL1P41146 370 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MARK4Q96L34 752 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SNX25Q9H3E2 840 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PIK3R2O00459 728 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CLOCKO15516 846 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 FGBP02675 491 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CA8P35219 290 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MAGEA12P43365 314 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK10P53779 464 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 BCAR1P56945 870 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TNK2Q07912 1038 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PERM1Q5SV97 790 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ITIH5Q86UX2 942 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PQLC3Q8N755 202 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 MUC3BQ9H195 1237 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 HMG20AQ9NP66 347 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CD300AQ9UGN4 299 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CYTH4Q9UIA0 394 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 SARDHQ9UL12 918 aa16.86■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 GMNNO75496 209 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 C7P10643 843 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ODC1P11926 461 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 NAT1P18440 290 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 HLCSP50747 726 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 CCT8P50990 548 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6V0D1P61421 351 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 PRKAA1Q13131 559 aa16.85■□□□□ 0.29
CNGA3-205ENST00000436404 TUBA3CQ13748 450 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms