RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NRF1Q16656 503 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TEX26Q8N6G2 289 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 EDEM1Q92611 657 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 ITFG2Q969R8 447 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MYRFLQ96LU7 910 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 UROC1Q96N76 676 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PKMYT1Q99640 499 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHAC1Q9H158 963 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHGB4Q9UN71 923 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa16.87■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0J9YYE9 177 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 M0QZ92 97 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 AZIN1O14977 448 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 EPOP01588 193 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 RHOQP17081 205 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 RANBP1P43487 201 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 EMP3P54852 163 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MYBPC3Q14896 1274 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FXNQ16595 210 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 UNC50Q53HI1 259 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TBCELQ5QJ74 424 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 ISCA2Q86U28 154 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 BBS5Q8N3I7 341 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TRPV3Q8NET8 790 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 SGF29Q96ES7 293 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 DOK1Q99704 481 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 ADI1Q9BV57 179 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 OSBPL6Q9BZF3 934 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 HIPK3Q9H422 1215 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 OCEL1Q9H607 264 aa16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0J9YVX5 310 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 NEMP2A6NFY4 417 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM64BA6NI03 449 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 H0YAE9 185 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 S1PR4O95977 384 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 KCNA5P22460 613 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 RALGDSQ12967 914 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 SLC36A3Q495N2 470 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 DLK2Q6UY11 383 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 OSCP1Q8WVF1 389 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 SLC29A1Q99808 456 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 CIB1Q99828 191 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PREBQ9HCU5 417 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PALMDQ9NP74 551 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 E9PAM4 449 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 M0QZQ0 153 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PDHXO00330 501 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 NME4O00746 187 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 KPNA6O60684 536 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 PFDN1O60925 122 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 SUPT7LO94864 414 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 TYMPP19971 482 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-DPA1P20036 260 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 ATP6V1B2P21281 511 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 GRIA3P42263 894 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 CCT8P50990 548 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MERTKQ12866 999 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 ARTNQ5T4W7 220 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 GPR180Q86V85 440 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FAM47BQ8NA70 645 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 FNDC8Q8TC99 324 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 MOCOSQ96EN8 888 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.85■□□□□ 0.29
HCLS1-202ENST00000428394 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.1 ms