RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 ITGAMP11215 1152 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 NPPBP16860 134 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CYP3A5P20815 502 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CMA1P23946 247 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PCSK6P29122 969 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CCNIQ14094 377 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 RESP18Q5W5W9 173 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 STAMQ92783 540 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 R3HDM4Q96D70 268 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ASB7Q9H672 318 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 MIOSQ9NXC5 875 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 DERAQ9Y315 318 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 MYO7AQ13402 2215 aa6.68□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 UBE4BO95155 1302 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 SYN3O14994 580 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 LINC01565O15544 149 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 IL9P15248 144 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ELF1P32519 619 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 SYKP43405 635 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CLCNKBP51801 687 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 BCAT1P54687 386 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PSMD5Q16401 504 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 FBLN7Q53RD9 439 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 SHC4Q6S5L8 630 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 RTL10Q7L3V2 364 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 HASPINQ8TF76 798 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 WDR24Q96S15 920 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TRIM9Q9C026 710 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 EXOC1Q9NV70 894 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 MARCH5Q9NX47 278 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 DAPP1Q9UN19 280 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CITO14578 2027 aa6.67□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TISP43B9A030 160 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CXCL8P10145 99 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PDE6CP51160 858 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 KRTAP10-2P60368 255 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 FOXO1Q12778 655 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 EFEMP1Q12805 493 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 UPP1Q16831 310 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 XKR4Q5GH76 650 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 METTL23Q86XA0 190 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ELMOD1Q8N336 334 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 RRN3Q9NYV6 651 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 NCOR1O75376 2440 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TTC26A0AVF1 554 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 A1L4Q6 167 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 OR2W5A6NFC9 320 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 TEX28O15482 410 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 GLP2RO95838 553 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 EDN1P05305 212 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CHRM2P08172 466 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 ODC1P11926 461 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CKMT1AP12532 417 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 PNPLA4P41247 253 aa6.66□□□□□ -1.34
USP40-202ENST00000409945 CLCN4P51793 760 aa6.66□□□□□ -1.34
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