RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 CCT8L2Q96SF2 557 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 HEPHQ9BQS7 1158 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 GTSE1Q9NYZ3 720 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 PLA2G4CQ9UP65 541 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 CDH23Q9H251 3354 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 A0A096LPK6 155 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 WDR91A4D1P6 747 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 PRRT4C9JH25 899 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 NDUFAB1O14561 156 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 HNF1BP35680 557 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 ADGRE1Q14246 886 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 ZNF789Q5FWF6 425 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 GDPD4Q6W3E5 623 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 GALNT7Q86SF2 657 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 LRRC34Q8IZ02 419 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 PNPLA1Q8N8W4 532 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 VOPP1Q96AW1 172 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 DCDC2Q9UHG0 476 aa29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 CAPN8A6NHC0 703 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 OGNP20774 298 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 FOXN2P32314 431 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 ETV4P43268 484 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 POLD2P49005 469 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 CLCN5P51795 746 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 ARMC2Q8NEN0 867 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 ECHDC3Q96DC8 303 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 MTG2Q9H4K7 406 aa29.46■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa29.45■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 S1PR4O95977 384 aa29.45■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 PMLP29590 882 aa29.45■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 CPLX4Q7Z7G2 160 aa29.45■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 KLHL32Q96NJ5 620 aa29.45■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa29.45■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 TLK1Q9UKI8 766 aa29.45■■■□□ 2.31
LMO2-202ENST00000395833 ECI2O75521 394 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 FAM107AO95990 144 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 C2P06681 752 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 DHRS4L1P0CG22 281 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 MC4RP32245 332 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 GJA4P35212 333 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 SLC12A2P55011 1212 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 SEMA3AQ14563 771 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 PDK4Q16654 411 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 USP45Q70EL2 814 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 ZNF366Q8N895 744 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 TERB1Q8NA31 727 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 LRRC8CQ8TDW0 803 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 IL17CQ9P0M4 197 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 COL4A3Q01955 1670 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 DENND4AQ7Z401 1863 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 TMEM265A0A087WTH1 108 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 A0A1W2PQ67 120 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 PRSS56P0CW18 603 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 DRD4P21917 467 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 HMGCLP35914 325 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 GMPRP36959 345 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 OPRD1P41143 372 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 C16orf46Q6P387 395 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 MTSS1LQ765P7 747 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 CCDC63Q8NA47 563 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 NECTIN4Q96NY8 510 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 NDNQ99608 321 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 WASF2Q9Y6W5 498 aa29.44■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 NEFHP12036 1026 aa29.43■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 STMN1P16949 149 aa29.43■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 TAC1P20366 129 aa29.43■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 SERPINB4P48594 390 aa29.43■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 IRF9Q00978 393 aa29.43■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 INSCQ1MX18 579 aa29.43■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 IL36AQ9UHA7 158 aa29.43■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 TBC1D3BA6NDS4 549 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 A8MX80 341 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 CLDN7O95471 211 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 RAB10P61026 200 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 IRX4P78413 519 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 POU4F1Q01851 419 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 ARSIQ5FYB1 569 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 SMRP1Q8NCR6 262 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 TSNARE1Q96NA8 513 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa29.42■■■□□ 2.3
LMO2-202ENST00000395833 LEFTY1O75610 366 aa29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms