RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 LRRC6Q86X45 466 aa23.3■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.3■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.3■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 TRABDQ9H4I3 376 aa23.3■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 CD320Q9NPF0 282 aa23.3■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 IL17CQ9P0M4 197 aa23.3■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 ITM2BQ9Y287 266 aa23.3■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 SPINT1O43278 529 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 ITGB7P26010 798 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 HMGCLP35914 325 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 HCAR2Q8TDS4 363 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 ACBD3Q9H3P7 528 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PQ67 120 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 CCDC162PA2VCL2 907 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 MAN2B1O00754 1011 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 MYZAPP0CAP1 466 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 HOXB2P14652 356 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 PTSQ03393 145 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 TTMPQ5BVD1 217 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 PDPK2PQ6A1A2 396 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 SDE2Q6IQ49 451 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 RFLNAQ6ZTI6 216 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 ZFATQ9P243 1243 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 MID1O15344 667 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 STX7O15400 261 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 PRSS56P0CW18 603 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 CHRNB1P11230 501 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 PSMA3P25788 255 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 MSH2P43246 934 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 LAMB3Q13751 1172 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 TMEM92Q6UXU6 159 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 DSG4Q86SJ6 1040 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 DENND6AQ8IWF6 608 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 KRT222Q8N1A0 295 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 PEX13Q92968 403 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 ZMYND15Q9H091 742 aa23.28■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 RPP40O75818 363 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 IVLP07476 585 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 PAMP19021 973 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 E2F5Q15329 346 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 CST6Q15828 149 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 FBXO43Q4G163 708 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 KCTD16Q68DU8 428 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 NDUFAF2Q8N183 169 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 AADATQ8N5Z0 425 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 WNT16Q9UBV4 365 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 FETUBQ9UGM5 382 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 SLC24A2Q9UI40 661 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 FBXL21Q9UKT6 434 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 GOT2P00505 430 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 DRD3P35462 400 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 PRAMEP78395 509 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 CNTN1Q12860 1018 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 CTBP1Q13363 440 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 FZD5Q13467 585 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 NEPROQ6NW34 567 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 TDRPQ86YL5 185 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 SIX5Q8N196 739 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 ASB2Q96Q27 587 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 SERGEFQ9UGK8 458 aa23.27■■□□□ 1.32
CNN3-202ENST00000394202 SLC7A4O43246 635 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 CDH16O75309 829 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 ADRB3P13945 408 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 P2RY2P41231 377 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 RPS14P62263 151 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 PRKCQQ04759 706 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 RALGDSQ12967 914 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 STARD3Q14849 445 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 FBXL19Q6PCT2 694 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 OR2T3Q8NH03 318 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 FOXQ1Q9C009 403 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 PKP3Q9Y446 797 aa23.26■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 GPR39O43194 453 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 OPA1O60313 960 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 C1SP09871 688 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 BPIP17213 487 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 XPAP23025 273 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 GABRB3P28472 473 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 MMP12P39900 470 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 ABCG1P45844 678 aa23.25■■□□□ 1.31
CNN3-202ENST00000394202 DMTNQ08495 405 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms