RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 TSPAN6O43657 245 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 PCDH8O95206 1070 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 CDKN3Q16667 212 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 SAYSD1Q9NPB0 183 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 HACD3Q9P035 362 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 PLAAQ9Y263 795 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa29.6■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3EA0A087X179 549 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3LB9A6J9 549 aa29.6■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 AURKAO14965 403 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN7O95471 211 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3HP0C7X1 549 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEA3P43357 314 aa29.6■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 ANGPT1Q15389 498 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM52BQ4KMG9 183 aa29.6■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 LRRC66Q68CR7 880 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 WDR5BQ86VZ2 330 aa29.6■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 MED4Q9NPJ6 270 aa29.6■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 NFS1Q9Y697 457 aa29.6■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC4A1P02730 911 aa29.59■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 MGAT1P26572 445 aa29.59■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 GPR63Q9BZJ6 419 aa29.59■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 TRABDQ9H4I3 376 aa29.59■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 PREBQ9HCU5 417 aa29.59■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC72A6NJI9 287 aa29.58■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 ELFN1P0C7U0 828 aa29.58■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 LIG3P49916 1009 aa29.58■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
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ECHS1-201ENST00000368547 NINJ2Q9NZG7 142 aa29.58■■■□□ 2.33
ECHS1-201ENST00000368547 H0Y858 1186 aa29.57■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 ABHD2P08910 425 aa29.57■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC29A2Q14542 456 aa29.57■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 SH3GL2Q99962 352 aa29.57■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 GPR174Q9BXC1 333 aa29.57■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 IL22Q9GZX6 179 aa29.57■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 SYBUQ9NX95 663 aa29.57■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 ARL5AQ9Y689 179 aa29.57■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 MSS51Q4VC12 460 aa29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 MPP5Q8N3R9 675 aa29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 TTC30BQ8N4P2 665 aa29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 SDR42E2A6NKP2 422 aa29.56■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 SEL1L3Q68CR1 1132 aa29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 NEK5Q6P3R8 708 aa29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 LRFN3Q9BTN0 628 aa29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 SCN8AQ9UQD0 1980 aa29.56■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 DOCK9Q9BZ29 2069 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PQU0 124 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8CPA6NN73 597 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 LDB2O43679 373 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 BUD23O43709 281 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
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