RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 EBF3Q9H4W6 596 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAUS2Q9NVX0 235 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RCOR1Q9UKL0 485 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEPT1Q9Y6K0 416 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAU2Q9Y6X3 613 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 EVPLQ92817 2033 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01553A4QN01 128 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 A8MZ25 164 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGES3LE9PB15 166 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCRTR2O43614 444 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOK2O60496 412 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNJ13O60928 360 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FTCDO95954 541 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXC6P09630 235 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 G6PDP11413 515 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RARGP13631 454 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX5P17844 614 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAOAP21397 527 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMO1P25800 156 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TM4SF1P30408 202 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIK3CAP42336 1068 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD23BP54727 409 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00205P59089 165 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBED6P86452 979 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFAP4Q01664 338 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 EGR4Q05215 589 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAF2Q12933 501 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKG2Q13237 762 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLCB4Q15147 1175 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFNB3Q15768 340 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEA1Q16626 185 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT24Q2M2I5 525 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2orf68Q2NKX9 166 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA1Q5VX52 437 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGNBP1Q5YKI7 109 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM205BPQ63HN1 556 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD54Q6NXT1 300 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEPT14Q6ZU15 432 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPPA4Q7L190 304 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TICAM1Q8IUC6 712 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX11Q8IYF3 940 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM216AQ8WUB2 273 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGCDQ92629 289 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIB2Q96AX9 1013 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCGF1Q9BSM1 259 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAUS8Q9BT25 410 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C17orf75Q9HAS0 396 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNGB3Q9NQW8 809 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D29Q9UFV1 150 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS28Q9UK41 221 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHA7Q9UN72 937 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR34Q9UPC5 381 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SESN1Q9Y6P5 492 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 hDV102S1A0JD36 115 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NCN8 305 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS47A8MTI9 375 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCAMP1O15126 338 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 VILLO15195 856 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLUD1P00367 558 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RB1P06400 928 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS2P07478 247 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM11P17152 192 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALOX12P18054 663 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCM3P25205 808 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 STX2P32856 288 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMB10P40306 273 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HADHAP40939 763 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLUD2P49448 558 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTR6P50406 440 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDH8P55286 799 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MC1RQ01726 317 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSM2AQ08AH3 577 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRMPQ12912 555 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAB2Q15742 525 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADIPOQQ15848 244 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTF1Q16619 201 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms