RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 FDXRP22570 491 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ARSDP51689 593 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 DSC2Q02487 901 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 KIF19Q2TAC6 998 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SIRPB2Q5JXA9 342 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ERMP1Q7Z2K6 904 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZUFSPQ96AP4 578 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PTERQ96BW5 349 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 C3orf30Q96M34 536 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PTPN18Q99952 460 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SLC39A3Q9BRY0 314 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZYG11BQ9C0D3 744 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SP110Q9HB58 689 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ABCD2Q9UBJ2 740 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CEPT1Q9Y6K0 416 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PLXNA3P51805 1871 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0J9YYE9 177 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF839A8K0R7 811 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 J3KR12 359 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CHRNA1P02708 482 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 FGF4P08620 206 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TSPAN8P19075 237 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 KCNC1P48547 511 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TNK2Q07912 1038 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CCL14Q16627 93 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PPP4R4Q6NUP7 873 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PACRGLQ8N7B6 248 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SLC29A1Q99808 456 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 AKTIPQ9H8T0 292 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM248Q9NWD8 314 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 NR5A2O00482 541 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF623O75123 536 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TIPRLO75663 272 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CD1DP15813 335 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ATP6V1B2P21281 511 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 GRIA3P42263 894 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ATP6V0D1P61421 351 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TUBA4AP68366 448 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TUSC3Q13454 348 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 EML3Q32P44 896 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MSANTD2Q6P1R3 559 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 RETREG3Q86VR2 466 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF683Q8IZ20 524 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 HM13Q8TCT9 377 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TADA1Q96BN2 335 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 UROC1Q96N76 676 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TCF12Q99081 682 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 POPDC3Q9HBV1 291 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PHF24Q9UPV7 400 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD36A6QL64 1941 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GTW7 788 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 AQP12BA6NM10 295 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 AKAP10O43572 662 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 LDB2O43679 373 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TYMPP19971 482 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SLC5A2P31639 672 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ALDH3B2P48448 385 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SH3BP2P78314 561 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ACVR1Q04771 509 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 BNIP2Q12982 314 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 AQP12AQ8IXF9 295 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MIER2Q8N344 545 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TEX26Q8N6G2 289 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PNPLA1Q8N8W4 532 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 OR52K2Q8NGK3 314 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CANT1Q8WVQ1 401 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PEX13Q92968 403 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.513e-8■■■■■ 70.6
SPNS3-201ENST00000355530 SLC39A13Q96H72 371 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SUSD3Q96L08 255 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SPON1Q9HCB6 807 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CPA4Q9UI42 421 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms