RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 ZBTB16Q05516 673 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 HDAC10Q969S8 669 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 RHOJQ9H4E5 214 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.15■□□□□ 0.82
SUMO3-201ENST00000332859 C2orf81A6NN90 581 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CISD3P0C7P0 127 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 GRK2P25098 689 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SERPINA4P29622 427 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SLC1A2P43004 574 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 KRT72Q14CN4 511 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ACCSLQ4AC99 568 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 C16orf46Q6P387 395 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 VPS39Q96JC1 886 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 WWP1Q9H0M0 922 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 EBF3Q9H4W6 596 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CLEC1BQ9P126 229 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.14■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SERPINE1P05121 402 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SERPINB3P29508 390 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 POLD2P49005 469 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ARSDP51689 593 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 PCLAFQ15004 111 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 DLG2Q15700 870 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 GEN1Q17RS7 908 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 MYLK3Q32MK0 819 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CARD16Q5EG05 197 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CES4AQ5XG92 561 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 PAF1Q8N7H5 531 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TRIM24O15164 1050 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 PIGNO95427 931 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ASLP04424 464 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 PTPN4P29074 926 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SLC8A1P32418 973 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 NNMTP40261 264 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 MPP1Q00013 466 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 RAD51Q06609 339 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CTBP1Q13363 440 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 PPM1JQ5JR12 505 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM215Q68D42 235 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 LCA5Q86VQ0 697 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 GPR22Q99680 433 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 S1PR5Q9H228 398 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 COPG2Q9UBF2 871 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.13■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TULP3O75386 442 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 AHSGP02765 367 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ABL2P42684 1182 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CD151P48509 253 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 MNAT1P51948 309 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 IRX4P78413 519 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 GRM3Q14832 879 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 VITQ6UXI7 678 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 CLEC14AQ86T13 490 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 C12orf40Q86WS4 652 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 PLPP6Q8IY26 295 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 TBATAQ96M53 351 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 MYADMQ96S97 322 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-201ENST00000332859 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms