RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 CERCAMQ5T4B2 595 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 NEK5Q6P3R8 708 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM131AQ6UXB0 335 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SUSD6Q92537 303 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RHOJQ9H4E5 214 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 BRD9Q9H8M2 597 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MC4RP32245 332 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RAET1GQ6H3X3 334 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 NRCAMQ92823 1304 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PSEN1P49768 467 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN5P54829 565 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK18Q07002 472 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 NOMO1Q15155 1222 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf52Q5T4I8 152 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF11Q9UIL8 331 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINB7O75635 380 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT18Q6P9A2 607 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CTPS1P17812 591 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 LPIN1Q14693 890 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 DSELQ8IZU8 1212 aa24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN5O00501 218 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A2P23975 617 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MTHFRP42898 656 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC185Q8N715 623 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF607Q96SK3 696 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMOQ9BU70 441 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 C8orf4Q9NR00 106 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 WWP2O00308 870 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 AMHP03971 560 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR1P46091 355 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 C5orf22Q49AR2 442 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 AHI1Q8N157 1196 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RPTORQ8N122 1335 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC189A1A4V9 331 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 AP3D1O14617 1153 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNA16P05015 189 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FGF1P05230 155 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TGFBR2P37173 567 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 OMPP47874 163 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 STARP49675 285 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 GALK1P51570 392 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RALGDSQ12967 914 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 IL18R1Q13478 541 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2T3Q8NH03 318 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CIB1Q99828 191 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TP73O15350 636 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIBP23284 216 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PUDPQ08623 228 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TINF2Q9BSI4 451 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MAT2BQ9NZL9 334 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 U3KQV3 271 aa24.17■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 QSOX1O00391 747 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 HNF4AP41235 474 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 C7orf26Q96N11 449 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MCUBQ9NWR8 336 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOC2Q96KP1 924 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC14BA6NHZ5 514 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC28A2O43868 658 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 AIF1P55008 147 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 WNT3AP56704 352 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT5Q7Z7M9 940 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 NR2F6P10588 404 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC28BQ9BUN5 200 aa24.16■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX28O15482 410 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TPSB2P20231 275 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TPSAB1Q15661 275 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RPTNQ6XPR3 784 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD9Q96Q07 612 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD17B14Q9BPX1 270 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP16Q9BY84 665 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms