RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.4■□□□□ 0.86
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSMD8P48556 350 aa20.39■□□□□ 0.86
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.39■□□□□ 0.86
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC18A1P54219 525 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCL2L1Q07817 233 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HMGB4Q8WW32 186 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GABRG2P18507 467 aa20.37■□□□□ 0.85
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