RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 A8MU76 341 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SNPHO15079 494 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 INPP4BO15327 924 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 DAB1O75553 588 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 RECKO95980 971 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM23P36406 574 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MMP12P39900 470 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LIG3P49916 1009 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SUOXP51687 545 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 BIRC2Q13490 618 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ISM2Q6H9L7 571 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf60Q96EN9 201 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 HMCESQ96FZ2 354 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CPXM1Q96SM3 734 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ZMYND15Q9H091 742 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 WDCPQ9H6R7 721 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH12Q9NPG4 1184 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 RRN3Q9NYV6 651 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CREG1O75629 220 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K6O95382 1288 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF28P17035 718 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PTMSP20962 102 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 XYLT1Q86Y38 959 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 DRC7Q8IY82 874 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 RNF31Q96EP0 1072 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ULBP3Q9BZM4 244 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MAP10Q9P2G4 905 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN11A1L157 253 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 A6NCN8 305 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 KRT86O43790 486 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPCS1-201ENST00000233025 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLC6A19Q695T7 634 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPCS1-201ENST00000233025 LEKR1Q6ZMV7 388 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PELI3Q8N2H9 469 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPCS1-201ENST00000233025 NPY6RQ99463 290 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MFRPQ9BY79 579 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ZYG11BQ9C0D3 744 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPCS1-201ENST00000233025 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa16.41■□□□□ 0.22
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SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 P4HA2O15460 535 aa16.4■□□□□ 0.22
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SPCS1-201ENST00000233025 LRCH4O75427 683 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 NFKBIAP25963 317 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R2P41236 205 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 FASLGP48023 281 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GCNT1Q02742 428 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CHAF1BQ13112 559 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 STIM1Q13586 685 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 UGP2Q16851 508 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 RRAGAQ7L523 313 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 NELFBQ8WX92 580 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.4■□□□□ 0.22
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