RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 RFX3P48380 749 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 LAPTM5Q13571 262 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 RUNX3Q13761 415 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 MYLK3Q32MK0 819 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 RDH11Q8TC12 318 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 TMEM40Q8WWA1 233 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 AIF1LQ9BQI0 150 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 C10orf88Q9H8K7 445 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SYBUQ9NX95 663 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 THEGQ9P2T0 379 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 TTC36A6NLP5 189 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 COCHO43405 550 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SEC22BO75396 215 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ATP6V1C1P21283 382 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SSTR1P30872 391 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SUOXP51687 545 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 NRLP54845 237 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ZNF33AQ06730 810 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 MIOSQ9NXC5 875 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 COG5Q9UP83 839 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 NDUFB5O43674 189 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 PRAMEF1O95521 474 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 THRAP10827 490 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CAPZA2P47755 286 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 KCNQ1P51787 676 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 AP2B1P63010 937 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CYP51A1Q16850 503 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 GPR33Q49SQ1 333 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 UBXN11Q5T124 520 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 HGSNATQ68CP4 663 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 FOXJ1Q92949 421 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 POMKQ9H5K3 350 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 KCND1Q9NSA2 647 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SUFUQ9UMX1 484 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CCDC189A1A4V9 331 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CCDC166P0CW27 439 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 DRD1P21728 446 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ZNF614Q8N883 585 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 USP6NLQ92738 828 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 TWNKQ96RR1 684 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CA14Q9ULX7 337 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ZNF840PA6NDX5 716 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SLC28A1O00337 649 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 NBNO60934 754 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 OTCP00480 354 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 CDH3P22223 829 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 ESRRGP62508 458 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 GBE1Q04446 702 aa7.99□□□□□ -1.13
NANOG-201ENST00000229307 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms