RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 AKTIPQ9H8T0 292 aa27.1■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 SUPT3HO75486 399 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 MT-ND1P03886 318 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 CAPN3P20807 821 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 MYF6P23409 242 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 FGD3Q5JSP0 725 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 GPR158Q5T848 1215 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM207Q6UWW9 146 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM26Q6ZUK4 368 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 PIM3Q86V86 326 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 IFNEQ86WN2 208 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 UBXN10Q96LJ8 280 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 BDNFP23560 247 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 WNT3AP56704 352 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 ACAP2Q15057 778 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 CROCCP3Q8IVE0 287 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 SLC15A3Q8IY34 581 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 THAP11Q96EK4 314 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF236Q9UL36 1845 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 H3BMQ9 156 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 IMPDH1P20839 514 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 GEN1Q17RS7 908 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 MFSD2AQ8NA29 543 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 TRPC4APQ8TEL6 797 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 COG8Q96MW5 612 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 LRRC14BA6NHZ5 514 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 PAGE1O75459 146 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 KIAA0408Q6ZU52 694 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 SCAMP5Q8TAC9 235 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 MYLPFQ96A32 169 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 HIPK3Q9H422 1215 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 VWA7Q9Y334 891 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM149A-201ENST00000227065 EI24O14681 340 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 CDKN2DP55273 166 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 GRB7Q14451 532 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 SLC22A9Q8IVM8 553 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 PRKD2Q9BZL6 878 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 MPP6Q9NZW5 540 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 MSI1O43347 362 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 APLP1P51693 650 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 CLCN5P51795 746 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 RAB39AQ14964 217 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 HACD2Q6Y1H2 254 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 CMTM6Q9NX76 183 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 V9GYQ6 96 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 TRIM64CA6NLI5 447 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 F2P00734 622 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 CCR3P51677 355 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 FOXA1P55317 472 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 NEDD8Q15843 81 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 SLC36A3Q495N2 470 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF678Q5SXM1 525 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 GAD1Q99259 594 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 PAAF1Q9BRP4 392 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 CDH9Q9ULB4 789 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 DOLKQ9UPQ8 538 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 FXYD1O00168 92 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 CLOCKO15516 846 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 FAM163BP0C2L3 166 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 FASP25445 335 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 VARSP26640 1264 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 SH3BP2P78314 561 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 TNIP2Q8NFZ5 429 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 OR52K2Q8NGK3 314 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 OR6P1Q8NGX9 317 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 ROPN1LQ96C74 230 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 KCNA7Q96RP8 456 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 NUDT5Q9UKK9 219 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 IL10P22301 178 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 ACADVLP49748 655 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 PLCL1Q15111 1095 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 UNC50Q53HI1 259 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 ISCA2Q86U28 154 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM86AQ8N2M4 240 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 HDAC10Q969S8 669 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 TSPAN17Q96FV3 270 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM149A-201ENST00000227065 MIOSQ9NXC5 875 aa27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms