RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vgll3P85442 326 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Snx31Q6P8Y7 439 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trpm4Q7TN37 1213 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr855Q7TRF8 312 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slco6c1Q8C0X7 706 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem72Q8C3K5 275 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Psma8Q9CWH6 250 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 GmprQ9DCZ1 345 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ap4b1Q9WV76 738 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 GghQ9Z0L8 317 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Il18rapQ9Z2B1 614 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Col4a4Q9QZR9 1682 aa15.5■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sppl2cA2A6C4 690 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kcna10B2RQA1 511 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm3183D3YUJ6 481 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm3139J3QK78 481 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm3106J3QPH3 481 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Smad6O35182 495 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cd151O35566 253 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ankmy2Q3TPE9 440 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp560Q3URI6 754 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem164Q6PHN7 296 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Defb14Q7TNV9 67 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TbcdQ8BYA0 1196 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc5a9Q8VDT1 685 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TmlheQ91ZE0 421 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nt5c3aQ9D020 331 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PapolbQ9WVP6 641 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Armt1A6H630 439 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mgat4eA6H684 439 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 2310061I04RikB8JJ69 315 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm10715J3QP74 227 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ltb4rO88855 351 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cd4P06332 457 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cd9P40240 226 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sash1P59808 1230 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 StyxQ60969 223 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pabpc2Q62029 628 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ablim3Q69ZX8 682 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp438Q8BFX2 798 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cfap61Q8CEL2 1252 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 OlahQ8R197 265 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mapk8Q91Y86 384 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pdzd3Q99MJ6 498 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ppil6Q9D6D8 278 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MrgbpQ9DAT2 204 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Krt7Q9DCV7 457 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fzd5Q9EQD0 585 aa15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Klhl32A2AJX0 620 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CatsperbA2RTF1 1109 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Socs5O54928 536 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 P01668 110 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hnf1bP27889 558 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Acvr1P37172 509 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Polr3bP59470 1133 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tial1P70318 392 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nudt18Q3U2V3 323 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 StradaQ3UUJ4 431 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fam81aQ3UXZ6 364 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Il10raQ61727 575 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nlrp9cQ66X01 1004 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cntn4Q69Z26 1026 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc16a9Q7TM99 508 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem108Q8BHE4 574 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PolbQ8K409 335 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AmotQ8VHG2 1126 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ggt7Q99JP7 662 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Atoh8Q99NA2 322 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pebp4Q9D9G2 242 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gria4Q9Z2W8 902 aa15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 SelenovD3YXG1 328 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r76F8VQ63 324 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm21738J3QP72 227 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Npr1P18293 1057 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CblP22682 913 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ces1cP23953 554 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Msh2P43247 935 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Aldh3a1P47739 453 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem207P86045 143 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TigitP86176 249 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CenplQ3U3S3 329 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slfn4Q3UV66 602 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ScinQ60604 715 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Plk4Q64702 925 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Atp2c1Q80XR2 918 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.9 ms