RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r5K7N788 911 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 InvsO89019 1062 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxk1P42128 719 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Timm13P62075 95 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hrh2P97292 397 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SPINDOCQ05AH6 381 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1062Q7TR71 315 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr295Q7TS08 309 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Amigo2Q80ZD9 519 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TiparpQ8C1B2 657 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IrgcQ8C262 412 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klrb1fQ8VD98 217 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trmt11Q9CWH5 460 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slco1c1Q9ERB5 715 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AgkQ9ESW4 421 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TpteG5E8H5 664 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnk4O88454 398 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gria2P23819 883 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OxtrP97926 388 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grin2cQ01098 1239 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Naaladl1Q7M758 745 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DhddsQ99KU1 333 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr89Q9D0R9 386 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2010109A12RikQ9D875 119 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slfn2Q9Z0I6 378 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Shroom3Q9QXN0 1986 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc16a6B1AT66 607 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gabpb1Q00420 383 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr174Q3U507 335 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgap11aQ80Y19 987 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dennd2dQ91VV4 469 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf167Q91XF4 347 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudt7Q99P30 236 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrpl17Q9D8P4 176 aa16.1■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prrt4B2RU40 902 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C1qbP14106 253 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mthfd2P18155 350 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubxn2bQ0KL01 331 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Six3Q62233 333 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem151aQ6GQT5 468 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q6GQU0 248 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bend6Q6PFX2 281 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7247Q6UY52 187 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf784Q8BI69 297 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Camk1dQ8BW96 385 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plcl2Q8K394 1128 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pbld2Q9CXN7 288 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam81bA0A140LI28 432 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21293E9Q4G9 266 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MutP16332 748 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ap1g1P22892 822 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stat5aP42230 793 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 WhammQ571B6 793 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mef2aQ60929 498 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sez6lQ6P1D5 963 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mppe1Q80XL7 396 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Noc4lQ8BHY2 516 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kiaa2013Q91X21 634 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pmf1Q9CPV5 202 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif12Q9D2Z8 642 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NplQ9DCJ9 320 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NrapQ80XB4 1728 aa16.09■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r27D3YUK6 857 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il4i1O09046 630 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stam2O88811 523 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csf3rP40223 837 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fut11Q8BHC9 489 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtbsQ8R242 366 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cybrd1Q925G2 290 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim16Q99PP9 556 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc17Q9CXD9 443 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Idh3aQ9D6R2 366 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adam17Q9Z0F8 827 aa16.08■□□□□ 0.17
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptchd4B9EKX1 904 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10477F6SW83 55 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam83fQ3UKU4 495 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr867Q7TRF3 331 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q80Y73 168 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gprc5aQ8BHL4 356 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Socs7Q8VHQ2 579 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata9Q9D9R3 252 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr703Q9EPF5 319 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AxlQ00993 888 aa16.08■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Treml2Q2LA85 329 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.8 ms