RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 AGKQ53H12 422 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 OGFOD2Q6N063 350 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 USP51Q70EK9 711 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 RETREG3Q86VR2 466 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 C19orf60Q96EN9 201 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SGF29Q96ES7 293 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SENP8Q96LD8 212 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 MYRFLQ96LU7 910 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 FICDQ9BVA6 458 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 KLK14Q9P0G3 267 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 NEMP2A6NFY4 417 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 AURKAO14965 403 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 ACOX3O15254 700 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 RASAL1O95294 804 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 GPIP06744 558 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 NAA20P61599 178 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 RALGDSQ12967 914 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 KANK2Q63ZY3 851 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 DLK2Q6UY11 383 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SULF1Q8IWU6 871 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TERB1Q8NA31 727 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 GPR150Q8NGU9 434 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 ISOC1Q96CN7 298 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 C1orf74Q96LT6 269 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CIB1Q99828 191 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 MED10Q9BTT4 135 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM15Q9C019 465 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 PLOD2O00469 737 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CSPG5O95196 566 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 FDXRP22570 491 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SLC7A2P52569 658 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CTBSQ01459 385 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CSHL1Q14406 222 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 UNC50Q53HI1 259 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 KRT80Q6KB66 452 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TEX26Q8N6G2 289 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 IPMKQ8NFU5 416 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 HIPK3Q9H422 1215 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SMOXQ9NWM0 555 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 MMP2P08253 660 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 INHBBP09529 407 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 FCGR1AP12314 374 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 HDCP19113 662 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00598-211ENST00000636621 SAT1P21673 171 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms