RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF542PQ5EBM4 170 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DUPD1Q68J44 220 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 JAMLQ86YT9 394 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF34Q969K3 372 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC8Q9BY41 377 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGVQ9NUD9 493 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO18BQ8IUG5 2567 aa24.36■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.36■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 TTI1O43156 1089 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ECEL1O95672 775 aa24.36■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 KRT81Q14533 505 aa24.36■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.36■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 WASF2Q9Y6W5 498 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DRGXA6NNA5 263 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 LIASO43766 372 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 HCAR3P49019 387 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 EMBQ6PCB8 327 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35B2Q8TB61 432 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 SIK2Q9H0K1 926 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa24.34■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.34■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 TNKS2Q9H2K2 1166 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 BSNQ9UPA5 3926 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 USP29Q9HBJ7 922 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 RP1P56715 2156 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF26BQ2KJY2 2108 aa24.32■■□□□ 1.48
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