RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FRS2	Q8WU20	508 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FGF14	Q92915	247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	E2F7	Q96AV8	911 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	IFT43	Q96FT9	208 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	AGAP2	Q99490	1192 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	KXD1	Q9BQD3	176 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GGT7	Q9UJ14	662 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NUMA1	Q14980	2115 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ANTXRL	A6NF34	631 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	WASH3P	C4AMC7	463 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PRRT4	C9JH25	899 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ANHX	E9PGG2	379 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ARNTL	O00327	626 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	AURKA	O14965	403 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ECI2	O75521	394 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PGLS	O95336	258 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PIGN	O95427	931 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	IGSF6	O95976	241 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	INHBA	P08476	426 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TGM1	P22735	817 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GABRB3	P28472	473 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC8A1	P32418	973 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GJA4	P35212	333 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PPARD	Q03181	441 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC18A2	Q05940	514 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NR1H3	Q13133	447 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RUNX3	Q13761	415 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SEPT6	Q14141	434 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PTPRCAP	Q14761	206 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MYLK3	Q32MK0	819 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CARD16	Q5EG05	197 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PACS1	Q6VY07	963 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	KCNMB4	Q86W47	210 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PLPP6	Q8IY26	295 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CHST14	Q8NCH0	376 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MDM1	Q8TC05	714 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SERAC1	Q96JX3	654 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TRABD	Q9H4I3	376 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NCDN	Q9UBB6	729 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ARL5A	Q9Y689	179 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916		A0A0U1RQS6	177 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TTC34	A8MYJ7	566 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CCL22	O00626	93 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TYROBP	O43914	113 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SOCS5	O75159	536 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SPAG7	O75391	227 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RFPL1	O75677	317 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	VAPB	O95292	243 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ASL	P04424	464 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SRF	P11831	508 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	BRAF	P15056	766 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GLUL	P15104	373 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PSMC3	P17980	439 aa		7.35	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms