RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD36A6QL64 1941 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PRSS38A1L453 326 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CCNB1P14635 433 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TCN2P20062 427 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 NR1D1P20393 614 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ADRA1BP35368 520 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 EFCAB3Q8N7B9 438 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TAAR2Q9P1P5 351 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM72CH0Y354 149 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 LRIG2O94898 1065 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FGF1P05230 155 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ELFN1P0C7U0 828 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CLCN1P35523 988 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MMP12P39900 470 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 STAT1P42224 750 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR3P46089 330 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CD97P48960 835 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 BPIFB4P59827 614 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 GRM3Q14832 879 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 AGERQ15109 404 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TRNP1Q6NT89 227 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 BRAT1Q6PJG6 821 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC30A9Q6PML9 568 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM72BQ86X60 149 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 EMC1Q8N766 993 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 STARD8Q92502 1023 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CTRCQ99895 268 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 LGR4Q9BXB1 951 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PILRAQ9UKJ1 303 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 B4E171 279 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MKRN2OSH3BPM6 223 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 THRAP10827 490 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MAN1A1P33908 653 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPAN7P41732 249 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 GABRB2P47870 512 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 UQCRFS1P47985 274 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PAK1Q13153 545 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MANEALQ5VSG8 457 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TAF3Q5VWG9 929 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PATE1Q8WXA2 126 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-205ENST00000588780 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 A8MU76 341 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 GNLYP22749 145 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 AK4P27144 223 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 GNPDA1P46926 289 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 ACOX1Q15067 660 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB6CQ53S08 254 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 CAMK1DQ8IU85 385 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 DPYSL5Q9BPU6 564 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 KLC2Q9H0B6 622 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 LHX3Q9UBR4 397 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPAN11A1L157 253 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 A1L4Q6 167 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 A8MX80 341 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 BIN1O00499 593 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 SDC4P31431 198 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 NR1D2Q14995 579 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 ASB18Q6ZVZ8 466 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 SSC4DQ8WTU2 575 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 RTP4Q96DX8 246 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-205ENST00000588780 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms