RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGAVP06756 1048 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CD59P13987 128 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 NFKB1P19838 968 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CA4P22748 312 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 NFKBIAP25963 317 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CXCR5P32302 372 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 IGFALSP35858 605 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 MMP12P39900 470 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 NXPH1P58417 271 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 PTSQ03393 145 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK18Q07002 472 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 OVGP1Q12889 678 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 RALGDSQ12967 914 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 SNX1Q13596 522 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF7Q14155 803 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 GALNT3Q14435 633 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 INPP5AQ14642 412 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 IRF4Q15306 451 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CNGA3Q16281 694 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 USP45Q70EL2 814 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 IQCHQ86VS3 1027 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC13Q8NBP0 860 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB124Q8NES8 71 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM58Q8NG06 486 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT43Q96FT9 208 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.323e-13■■■■■ 29.7
EFTUD2-211ENST00000588374 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 APOOQ9BUR5 198 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 TLR10Q9BXR5 811 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 USP29Q9HBJ7 922 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CD84Q9UIB8 345 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMA1P25391 3075 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GTQ1 180 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP104O60308 925 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 SDC3O75056 442 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNK5O95279 499 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 AGTP01019 485 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 PIRTP0C851 137 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 GM2AP17900 193 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ETV3P41162 512 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 RABIFP47224 123 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 THOP1P52888 689 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC14A1Q13336 389 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 AGERQ15109 404 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 SHBQ15464 509 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 QPCTQ16769 361 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1JQ5JR12 505 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 FAXCQ5TGI0 409 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC66Q68CR7 880 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 PNCKQ6P2M8 343 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZVL8 140 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms