RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSKH2Q96QS6 385 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEPT3Q9UH03 358 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARL5AQ9Y689 179 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H3BNC9 293 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AIM2O14862 343 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDST3O95803 873 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IMPDH1P20839 514 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDC25CP30307 473 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERFP50548 548 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NFKB2Q00653 900 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLC1Q07866 573 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GALNT3Q14435 633 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR158Q5T848 1215 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHSY3Q70JA7 882 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CUZD1Q86UP6 607 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 L3HYPDHQ96EM0 354 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SERPINI1Q99574 410 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRMOQ9BU70 441 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTRRQ9UBK8 725 aa16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDELR3O43731 214 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BAG2O95816 211 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INHBCP55103 352 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DSELQ8IZU8 1212 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC43Q8N309 656 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR7D4Q8NG98 312 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLD4Q96BZ4 506 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GSTO2Q9H4Y5 243 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STK39Q9UEW8 545 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.53■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A6NHS1 94 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAM12O43184 909 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLDN11O75508 207 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD1DP15813 335 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1QTNF8P60827 252 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.246e-8■■□□□ 14.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEMA3AQ14563 771 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL31Q6EBC2 164 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KBTBD6Q86V97 674 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PGAM4Q8N0Y7 254 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4L1Q8NH43 312 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RCN3Q96D15 328 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAPNS2Q96L46 248 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CREBZFQ9NS37 354 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.52■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRPA1O75762 1119 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GJB5O95377 273 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CR2P20023 1033 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSMA3P25788 255 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STC1P52823 247 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OXCT1P55809 520 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DSG1Q02413 1049 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPRCAPQ14761 206 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HECTD3Q5T447 861 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIM3Q86V86 326 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHF21BQ96EK2 531 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NACA2Q9H009 215 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALG9Q9H6U8 611 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms