RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 NUP85Q9BW27 656 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CLPBQ9H078 707 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CBX8Q9HC52 389 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 DNPEPQ9ULA0 475 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CPP00450 1065 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 AMPD1P23109 780 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ITPKBP27987 946 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 VIPR1P32241 457 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM23P36406 574 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MMP13P45452 471 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TMPRSS3P57727 454 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ARMC12Q5T9G4 340 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 HGSNATQ68CP4 663 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 GPR155Q7Z3F1 870 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CPLX3Q8WVH0 158 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 NUS1Q96E22 293 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MGME1Q9BQP7 344 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 THAP2Q9H0W7 228 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SATB2Q9UPW6 733 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CAPN8A6NHC0 703 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 MAFKO60675 156 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 CYP1A2P05177 515 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PYGLP06737 847 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TPM1P09493 284 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PNLIPP16233 465 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 IL1R2P27930 398 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TLE3Q04726 772 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 RALGDSQ12967 914 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PNCKQ6P2M8 343 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 LUZP1Q86V48 1076 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SPACA3Q8IXA5 215 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 HIC2Q96JB3 615 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM74Q96NL1 305 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PRORYQ9H606 182 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 AMACRQ9UHK6 382 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 ITPR1Q14643 2758 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-211ENST00000568829 PRKCGP05129 697 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 KRT7P08729 469 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 GLB1P16278 677 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 MX2P20592 715 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 ITKQ08881 620 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 BIRC2Q13490 618 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM14Q14142 442 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 PDK2Q15119 407 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 PERM1Q5SV97 790 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CRTC1Q6UUV9 634 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 KCTD6Q8NC69 237 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM159Q96B96 161 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 SCRN2Q96FV2 425 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 DEF6Q9H4E7 631 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 MYLKQ15746 1914 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CBFA2T2O43439 604 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 H2AFZP0C0S5 128 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CR2P20023 1033 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 TEAD1P28347 426 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 PBX1P40424 430 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 EPHB1P54762 984 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CXADRP78310 365 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms