RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-208ENST00000564123 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TXNDC15Q96J42 360 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 C1orf74Q96LT6 269 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 MAP7D2Q96T17 732 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 GPR108Q9NPR9 543 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ABI3Q9P2A4 366 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TBC1D29Q9UFV1 150 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.36□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 A0A1W2PRG0 241 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TMEM202A6NGA9 273 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 PTGES3LE9PB15 166 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 J3KR12 359 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ASAP2O43150 1006 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 NDUFB4O95168 129 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 G6PDP11413 515 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CHATP28329 748 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CDC25AP30304 524 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 HADHAP40939 763 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 OLIG2Q13516 323 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 NEDD9Q14511 834 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 MEA1Q16626 185 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 KLHL35Q6PF15 583 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 PCGF5Q86SE9 256 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 NEK9Q8TD19 979 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 SCFD2Q8WU76 684 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 DCLK3Q9C098 648 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 SH2D4AQ9H788 454 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 KAT14Q9H8E8 782 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 VPS28Q9UK41 221 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 RCOR1Q9UKL0 485 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 MYO6Q9UM54 1294 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 UTYO14607 1347 aa3.35□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 A0A1B0GVM2 712 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 DYTNA2CJ06 578 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 A6NCN8 305 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 OR6C75A6NL08 312 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 MYO1GB0I1T2 1018 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 BTBD18B2RXH4 712 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 VCYO14598 125 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 SLC25A12O75746 678 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 BMP15O95972 392 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CD58P19256 250 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 BDNFP23560 247 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TM4SF1P30408 202 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 PIK3CAP42336 1068 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CLCN3P51790 818 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 MC1RQ01726 317 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ST3GAL1Q11201 340 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 FHL1Q13642 323 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TWIST1Q15672 202 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 MTSS1LQ765P7 747 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 LINGO2Q7L985 606 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 AADATQ8N5Z0 425 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 POMGNT1Q8WZA1 660 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 CMTM3Q96MX0 182 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 SLITRK1Q96PX8 696 aa3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
BBS2-208ENST00000564123 GHITMQ9H3K2 345 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms