RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 CPXM2Q8N436 756 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-204ENST00000561685 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-204ENST00000561685 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-204ENST00000561685 FIG4Q92562 907 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-204ENST00000561685 TANKQ92844 425 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-204ENST00000561685 C3orf30Q96M34 536 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-204ENST00000561685 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3-204ENST00000561685 UGGT2Q9NYU1 1516 aa3.34□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CBY3A6NI87 242 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 STX16O14662 325 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ZIC3O60481 467 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 RFPL2O75678 378 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 RGS11O94810 467 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 SERPINB2P05120 415 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 SRCP12931 536 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CXCR3P49682 368 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 RUNX2Q13950 521 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 PRKG1Q13976 671 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 USP38Q8NB14 1042 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 AFG1LQ8WV93 481 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 SNAPC3Q92966 411 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 FBXO17Q96EF6 278 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 NOD2Q9HC29 1040 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 TCF19Q9Y242 345 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 KIF14Q15058 1648 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 A0A0G2JPF8 293 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 A0A0U1RQF3 1178 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 A0A1W2PS18 150 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 WEE2P0C1S8 567 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CETPP11597 493 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CD72P21854 359 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 KCNA5P22460 613 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 STX2P32856 288 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 VEGFCP49767 419 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 NR1H2P55055 460 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 NEDD9Q14511 834 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 KRT72Q14CN4 511 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ARHGEF6Q15052 776 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ESCO2Q56NI9 601 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CES5AQ6NT32 575 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 GJC3Q8NFK1 279 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 MAGEC3Q8TD91 643 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 TMEM19Q96HH6 336 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CGNL1Q0VF96 1302 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 UNC13BO14795 1591 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ABCC1P33527 1531 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 TNS2Q63HR2 1409 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 HSPB2A8KAH6 182 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 MID1O15344 667 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CEP104O60308 925 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 NDUFS7O75251 213 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 PIGAP37287 484 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CDKN1AP38936 164 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 IL15P40933 162 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 TRIM14Q14142 442 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 MORC3Q14149 939 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 ANKRD1Q15327 319 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 HSPB2Q16082 182 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3-204ENST00000561685 LRRC8CQ8TDW0 803 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms