RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558966.5

CTDSPL2-204, Transcript of CTD small phosphatase like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSPL2, Length 1,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2-204ENST00000558966 PRLRP16471 622 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 AMPD1P23109 780 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 IL4RP24394 825 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 CD38P28907 300 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 RGRP47804 291 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 ARSEP51690 589 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 ZNF75DP51815 510 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 TAS2R40P59535 323 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 RHOAP61586 193 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 FAM193AP78312 1265 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 ZNF284Q2VY69 593 aa6.09□□□□□ -1.43
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CTDSPL2-204ENST00000558966 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 CHSY3Q70JA7 882 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 HORMAD1Q86X24 394 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.09□□□□□ -1.43
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CTDSPL2-204ENST00000558966 KLK6Q92876 244 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 SERAC1Q96JX3 654 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 CCDC42Q96M95 316 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 DONSONQ9NYP3 566 aa6.09□□□□□ -1.43
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CTDSPL2-204ENST00000558966 DMTF1Q9Y222 760 aa6.09□□□□□ -1.43
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CTDSPL2-204ENST00000558966 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 USP24Q9UPU5 2620 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL2-204ENST00000558966 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 DFFAO00273 331 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 MUSKO15146 869 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 SLC31A1O15431 190 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 AP1G1O43747 822 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 SH3BP5O60239 455 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 IGSF6O95976 241 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 PEX11BO96011 259 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 MAN1A1P33908 653 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 GJC1P36383 396 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 ARL4AP40617 200 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 CDH6P55285 790 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 NXPH1P58417 271 aa6.09□□□□□ -1.44
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CTDSPL2-204ENST00000558966 FGL2Q14314 439 aa6.09□□□□□ -1.44
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CTDSPL2-204ENST00000558966 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.09□□□□□ -1.44
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CTDSPL2-204ENST00000558966 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 NAXDQ8IW45 347 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 LZTR1Q8N653 840 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 MYOCQ99972 504 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 SP110Q9HB58 689 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 FZD3Q9NPG1 666 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.09□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
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CTDSPL2-204ENST00000558966 A0A1B0GTQ1 180 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 AREL1O15033 823 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 MFSD11O43934 449 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 MAFKO60675 156 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 CBFA2T3O75081 653 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 MTA2O94776 668 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 PCDH8O95206 1070 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 PIGNO95427 931 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 ITIH2P19823 946 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 PMLP29590 882 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 NUDT1P36639 197 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 CCT8P50990 548 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 C21orf59P57076 290 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 IL9RQ01113 521 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 IL10RBQ08334 325 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL2-204ENST00000558966 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.08□□□□□ -1.44
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